《末代御医》以清末为背景,聚焦御医这一群体。杜仲(郭晋安 饰)本是一介草泽医,凭借精湛医术进入太医院。他性格正直善良,在太医院复杂的环境中坚守本心。杜仲与光绪皇帝(敖嘉年 饰)结识后,一心想为其医治痼疾。太医院内,杜仲面临着来自同行的排挤与刁难,如岳宗麟(杨明 饰)嫉妒他的才能,常与其针锋相对。同时,宫廷斗争波谲云诡,杜仲被卷入其中。皇后(周丽淇 饰)为巩固势力,也在太医院安插人手。杜仲在为皇帝治病、应对宫廷纷争的过程中,历经重重困难,却始终未忘医者仁心,在末代宫廷的风云变幻中,书写着自己独特的传奇故事。