《萌宝来自未来》围绕着拥有神秘身份的萌宝展开。萌宝来自未来世界，带着特殊使命穿越时空来到当下。他意外结识了善良但生活平凡的年轻女孩林悦。林悦起初对萌宝的出现感到惊讶和疑惑，但在相处过程中，被萌宝的可爱和懂事所打动，决定保护他。 然而，萌宝的到来也引来了未来世界的反派势力。他们企图抓住萌宝，阻止他完成使命。林悦和萌宝一边躲避反派的追捕，一边在寻找完成使命的方法。在这个过程中，萌宝利用未来的科技帮助林悦解决了生活中的诸多难题，两人的感情也愈发深厚。最终，他们能否成功战胜反派，让萌宝完成使命回到未来，充满了悬念与看点。